EN
Breeding and conservation programs often need to select individuals with the highest genetic potential while avoiding close relatives. The study presents a mathematical optimization method that imposes a strict limit on the genomic relationship between every pair of selected individuals.
Unlike approaches based only on average relatedness, the method prevents any selected pair from exceeding the chosen relationship threshold. It was demonstrated using a large Norway spruce breeding population and a conservation population of endangered German Black Pied cattle. For typical applications, the method can identify and verify globally optimal solutions within seconds.
The approach can support genetic improvement in breeding programs while also helping to maintain diversity in genetic reserves and endangered populations.
Read HERE.
CZ
Jak vybrat nejlepší jedince a současně se vyhnout blízkým příbuzným
Šlechtitelské programy a programy ochrany a reprodukce genofondu často potřebují vybrat jedince s nejvyšší genetickou hodnotou, ale zároveň zabránit výběru blízkých příbuzných. Studie představuje metodu matematické optimalizace, která stanovuje přísný limit genomické příbuznosti pro každou dvojici vybraných jedinců.
Na rozdíl od postupů založených pouze na průměrné příbuznosti metoda zaručuje, že žádná vybraná dvojice nepřekročí stanovenou hranici. Postup byl ověřen na rozsáhlé šlechtitelské populaci smrku ztepilého a na populaci ohroženého německého černostrakatého skotu. U běžných úloh lze globálně optimální řešení nalézt a matematicky ověřit během několika sekund.
Metoda může pomoci zvyšovat genetický zisk ve šlechtění a současně chránit genetickou rozmanitost ohrožených populací.